Si es de una expansion de spore,simplemente lo colocas en data,asi como los descargaste,y cuando entras al juego,aparece un cartel que dice "Actualizando la base de datos...",entonces,significa que tienes el MOD .
Si es para abrirlo y cerrarlo sin tocar nada no hace falta copiar nada, en el mismo archivo se puede hacer, si es para hacer algo, copias el .package en otro sitio como ha dicho Xtrems lo modificas lo cambias por el que no has tocado (pero sin borrar el original, moviendolo a otro lado) y pruebas lo que hayas hecho si da algún problema solo hay que reemplazar el original por el modificado.
Te recomiendo,que si eres inexperto,no toques eso.O hazlo,pero sin tenerlo en la DATA,porque eso quizas si te dañe el spore.Deberias consultar ayuda,ser eso es algo muy complejo y dificil...